報(bào)關(guān)工作的全部程序分為申報(bào)、查驗(yàn)、放行三個(gè)階段。
　　（一）進(jìn)出口貨物的申報(bào)
　　進(jìn)出口貨物的收、發(fā)貨人或者他們的代理人，在貨物進(jìn)出口時(shí)，應(yīng)在海關(guān)規(guī)定的期限內(nèi)，按海關(guān)規(guī)定的格式填寫進(jìn)出口貨物報(bào)關(guān)單，隨附有關(guān)的貨運(yùn)、商業(yè)單據(jù)，同時(shí)提供批準(zhǔn)貨物進(jìn)出口的證件，向海關(guān)申報(bào)。報(bào)關(guān)的主要單證有以下幾種：
　　進(jìn)口貨物報(bào)關(guān)單
　　一般填寫一式二份，報(bào)關(guān)單填報(bào)項(xiàng)目要準(zhǔn)確、齊全、字跡清楚，不能用鉛筆；報(bào)關(guān)單內(nèi)各欄目，凡海關(guān)規(guī)定有統(tǒng)計(jì)代號(hào)的，以及稅則號(hào)列及稅率一項(xiàng)，由報(bào)關(guān)員用紅筆填寫；每份報(bào)關(guān)單限填報(bào)四項(xiàng)貨物；如發(fā)現(xiàn)情況有無或其他情況需變更填報(bào)內(nèi)容的，應(yīng)主動(dòng)、及時(shí)向海關(guān)遞交更改單。
　　出口貨物報(bào)關(guān)單
　　一般填寫一式兩份，填單要求與進(jìn)口貨物報(bào)關(guān)單基本相同。如因填報(bào)有誤或需變更填報(bào)內(nèi)容而未主動(dòng)、及時(shí)更改的，出口報(bào)關(guān)后發(fā)生退關(guān)情況，報(bào)關(guān)單位應(yīng)在三天內(nèi)向海關(guān)辦理更正手續(xù)。
　　隨報(bào)關(guān)單交驗(yàn)的貨運(yùn)、商業(yè)單據(jù)
　　任何進(jìn)出口貨物通過海關(guān)，都必須在向海關(guān)遞交以填好的報(bào)關(guān)單的同時(shí)，交驗(yàn)有關(guān)的貨運(yùn)和商業(yè)單據(jù)，接受海關(guān)審核諸種單證是否一致，并由海關(guān)審核后加蓋印章，作為提取或發(fā)運(yùn)貨物的憑證。隨報(bào)關(guān)單同時(shí)交驗(yàn)的貨運(yùn)和商業(yè)單據(jù)有：海運(yùn)進(jìn)口提貨單；海運(yùn)出口裝貨單（需報(bào)關(guān)單位蓋章）；陸、空運(yùn)運(yùn)單；貨物的發(fā)票（其份數(shù)比報(bào)關(guān)單少一份，需報(bào)關(guān)單位蓋章等）；貨物的裝箱單（其份數(shù)與發(fā)票相等，需報(bào)關(guān)單位蓋章）等。需要說明的是如海關(guān)認(rèn)為必要，報(bào)關(guān)單位還應(yīng)交驗(yàn)貿(mào)易合同、定貨卡片、產(chǎn)地證明等。另外，按規(guī)定享受減、免稅或免驗(yàn)的貨物，應(yīng)在向海關(guān)申請(qǐng)并已辦妥手續(xù)后，隨報(bào)關(guān)單交驗(yàn)有關(guān)證明文件。
　　進(jìn)（出）口貨物許可證
　　進(jìn)出口貨物許可證制度，是對(duì)進(jìn)出口貿(mào)易進(jìn)行管理的一種行政保護(hù)手段。我國與世界上大多數(shù)國家一樣，也采用這一制度對(duì)進(jìn)出口貨物、物品實(shí)行全面管理。必須向海關(guān)交驗(yàn)進(jìn)出口貨物許可證的商品并不固定，而是由國家主管部門隨時(shí)調(diào)整公布。凡按國家規(guī)定應(yīng)申領(lǐng)進(jìn)出口貨物許可證的商品，報(bào)關(guān)時(shí)都必須交驗(yàn)由對(duì)外貿(mào)易管理部門簽發(fā)的進(jìn)出口貨物許可證，并經(jīng)海關(guān)查驗(yàn)合格無誤后始能放行。但對(duì)外經(jīng)濟(jì)貿(mào)易合作部所屬的進(jìn)出口公司、經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)經(jīng)營進(jìn)出口業(yè)務(wù)的個(gè)部位所屬的工貿(mào)公司、個(gè)省（直轄市、自治區(qū)）所屬的進(jìn)出口公司，在批準(zhǔn)的經(jīng)營范圍內(nèi)進(jìn)出口商品，視為以取得許可，免領(lǐng)進(jìn)出口貨物許可證，只憑報(bào)關(guān)單即可向海關(guān)申報(bào)；只有在經(jīng)營進(jìn)出口經(jīng)營范圍以外的商品時(shí)才需要交驗(yàn)許可證。
　　商檢證書
　　海關(guān)指示報(bào)關(guān)單位出具商檢證書，一方面是監(jiān)督法定檢驗(yàn)商品是否已經(jīng)接受法定的商檢機(jī)構(gòu)檢驗(yàn)；另一方面是取得進(jìn)出口商品征稅、免稅、減稅的依據(jù)。根據(jù)《中華人民共和國進(jìn)出口商品檢驗(yàn)法》以及《商檢機(jī)構(gòu)實(shí)施檢驗(yàn)的進(jìn)出口商品種類表》規(guī)定，凡列入《種類表》的法定檢驗(yàn)的進(jìn)出口商品，均應(yīng)在報(bào)關(guān)前向商品檢驗(yàn)機(jī)構(gòu)報(bào)驗(yàn)。報(bào)關(guān)時(shí)，對(duì)進(jìn)口商品，海關(guān)憑商檢機(jī)構(gòu)簽發(fā)的檢驗(yàn)證書或在進(jìn)口貨物報(bào)關(guān)單上加蓋的印章驗(yàn)收。
　　除上述單證外，對(duì)國家規(guī)定的其他進(jìn)出口管制貨物，報(bào)關(guān)單位也必須向海關(guān)提交由國家主管部門簽發(fā)的特定的進(jìn)出口貨物批準(zhǔn)單證，由海關(guān)查驗(yàn)合格無誤后再予以放行。諸如食品衛(wèi)生檢驗(yàn)，藥品檢驗(yàn)，動(dòng)植物檢疫，文物出口簽定，金銀及其制品的管理，珍貴稀有野生動(dòng)物的管理，進(jìn)出口射擊運(yùn)動(dòng)、狩獵用槍支彈藥和民用爆破物品的管理，進(jìn)出口音像制品的管理等均屬此列。
　　（二）進(jìn)出口貨物的查驗(yàn)
　　進(jìn)出口貨物，除海關(guān)總署特準(zhǔn)查驗(yàn)的以外，都應(yīng)接受海關(guān)查驗(yàn)。查驗(yàn)的目的是核對(duì)報(bào)關(guān)單證所報(bào)內(nèi)容與實(shí)際到貨是否相符，有無錯(cuò)報(bào)、漏報(bào)、瞞報(bào)、偽報(bào)等情況，審查貨物的進(jìn)出口是否合法。
　　海關(guān)查驗(yàn)貨物，應(yīng)在海關(guān)規(guī)定的時(shí)間和場所進(jìn)行。如有特殊理由，事先報(bào)經(jīng)海關(guān)同意，海關(guān)可以派人員在規(guī)定的時(shí)間和場所以外查詢。申請(qǐng)人應(yīng)提供往返交通工具和住宿并支付費(fèi)用。
　　海關(guān)查驗(yàn)貨物時(shí)，要求貨物的收、發(fā)貨人或其代理人必須到場，并按海關(guān)的要求負(fù)責(zé)辦理貨物的搬移、拆裝箱和查驗(yàn)貨物的包裝等工作。海關(guān)認(rèn)為必要時(shí)，可以徑行開驗(yàn)、復(fù)驗(yàn)或者提取貨樣、貨物保管人應(yīng)當(dāng)?shù)綀鲎鳛橐娮C人。
　　查驗(yàn)貨物時(shí)，由于海關(guān)關(guān)員責(zé)任造成被查貨物損壞的，海關(guān)應(yīng)按規(guī)定賠償當(dāng)事人的直接經(jīng)濟(jì)損失。賠償辦法：由海關(guān)關(guān)員如實(shí)填寫《中華人民共和國海關(guān)查驗(yàn)貨物，物品損壞報(bào)告書》一式兩份，查驗(yàn)關(guān)員和當(dāng)事人雙方簽字，各流一份。雙方共同商定貨物的受損程度或修理費(fèi)用（必要時(shí)，可憑公證機(jī)構(gòu)出具的鑒定證明確定），以海關(guān)審定的完稅價(jià)格為基數(shù)，確定賠償金額。賠償金額確定后，由海關(guān)填發(fā)《中華人民共和國海關(guān)損壞貨物、物品賠償通知單》，當(dāng)事人自收到《通知單》之日起，三個(gè)月內(nèi)憑單向海關(guān)領(lǐng)取賠款或?qū)y行帳號(hào)通知海關(guān)劃撥，逾期海關(guān)不再賠償。賠款一律用人民幣支付。
　　（三）進(jìn)出口貨物的放行
　　海關(guān)對(duì)進(jìn)出口貨物的報(bào)關(guān)，經(jīng)過審核報(bào)關(guān)單據(jù)、查驗(yàn)實(shí)際貨物，并依法辦理了征收貨物稅費(fèi)手續(xù)或減免稅手續(xù)后，在有關(guān)單據(jù)上簽蓋放行章，貨物的所有人或其代理人才能提取或裝運(yùn)貨物。此時(shí)，海關(guān)對(duì)進(jìn)出口貨物的監(jiān)管才算結(jié)束。
　　另外，進(jìn)出口貨物因各種原因需海關(guān)特殊處理的，可向海關(guān)申請(qǐng)擔(dān)保放行。海關(guān)對(duì)擔(dān)保的范圍和方式均有明確的規(guī)定。
　　再詳細(xì)點(diǎn)說如下：
　　進(jìn)口報(bào)關(guān)的基本程序：接受申報(bào)→審核單證→查驗(yàn)貨物→辦理征稅→結(jié)關(guān)放行。
　　1.用換來的提貨單（1、3）聯(lián)并附上報(bào)關(guān)單據(jù)前去報(bào)關(guān)。報(bào)關(guān)單據(jù)：提貨單（1、3）聯(lián)海關(guān)放行后，在白聯(lián)上加蓋放行章，發(fā)還給進(jìn)口方作為提貨的憑證。正本箱單、正本發(fā)票、合同、進(jìn)口報(bào)關(guān)單一式兩份、正本報(bào)關(guān)委托協(xié)議書、海關(guān)監(jiān)管條件所涉及的各類證件。
　　注意事項(xiàng):
　　（1）接到客戶全套單據(jù)后，應(yīng)確認(rèn)貨物的商品編碼，然后查閱海關(guān)稅則，確認(rèn)進(jìn)口稅率、確認(rèn)貨物需要什么監(jiān)管條件，如需做各種檢驗(yàn)，則應(yīng)在報(bào)關(guān)前向有關(guān)機(jī)構(gòu)報(bào)驗(yàn)。報(bào)驗(yàn)所需單據(jù)：報(bào)驗(yàn)申請(qǐng)單、正本箱單發(fā)票、合同、進(jìn)口報(bào)關(guān)單兩份。
　　（2）換單時(shí)應(yīng)催促船舶代理部門及時(shí)給海關(guān)傳艙單，如有問題應(yīng)與海關(guān)艙單室取得聯(lián)系，確認(rèn)艙單是否轉(zhuǎn)到海關(guān)。
　　（3）當(dāng)海關(guān)要求開箱查驗(yàn)貨物時(shí)，應(yīng)提前與場站取得聯(lián)系，調(diào)配機(jī)力將所查箱子調(diào)至海關(guān)指定的場站。（事先應(yīng)與場站確認(rèn)好調(diào)箱費(fèi)、掏箱費(fèi)。）
　　2.若是法檢商品應(yīng)辦理驗(yàn)貨手續(xù)。
　　如需商檢，則要在報(bào)關(guān)前，拿進(jìn)口商檢申請(qǐng)單（帶公章）和兩份報(bào)關(guān)單辦理登記手續(xù)，并在報(bào)關(guān)單上蓋商檢登記在案章以便通關(guān)。驗(yàn)貨手續(xù)在最終目的地辦理。如需動(dòng)植檢，也要在報(bào)關(guān)前拿箱單發(fā)票合同報(bào)關(guān)單去代報(bào)驗(yàn)機(jī)構(gòu)申請(qǐng)報(bào)驗(yàn)，在報(bào)關(guān)單上蓋放行以便通關(guān)，驗(yàn)貨手續(xù)可在通關(guān)后堆場進(jìn)行。

報(bào)檢業(yè)務(wù)流程大致可分為：報(bào)檢申請(qǐng)（報(bào)檢人提供外貿(mào)合同、發(fā)票、提單、裝箱單、信用證等單證；實(shí)施安全質(zhì)量許可、衛(wèi)生檢疫注冊(cè)的應(yīng)提交有關(guān)證明文件復(fù)印件，并在報(bào)檢單上注名文件號(hào)）；報(bào)檢（將申請(qǐng)的相關(guān)信息錄入CIQ2000系統(tǒng)，并將相關(guān)單證遞交檢驗(yàn)檢疫局檢務(wù)部門受理）；施檢部門施檢（施檢部門接受單據(jù)、確認(rèn)、檢驗(yàn)、結(jié)果登記、擬制證稿、審核簽字）；簽發(fā)證書（檢務(wù)部門對(duì)施檢部門擬稿審核，并簽發(fā)證書）。
入境貨物的檢驗(yàn)檢疫工作程序可以分為：申請(qǐng)報(bào)檢、受理報(bào)檢、辦理通關(guān)、實(shí)施檢驗(yàn)檢疫、放行
　　1）法定檢驗(yàn)檢疫入境貨物的貨主或其代理人首先向卸貨口岸或到達(dá)站的出入境檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu)申請(qǐng)報(bào)檢。
　　2）檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu)受理報(bào)檢，轉(zhuǎn)施檢部門簽署意見，計(jì)收費(fèi)。
　　3）對(duì)來自疫區(qū)的、可能傳播傳染病、動(dòng)植物疫情的入境貨物交通工具或運(yùn)輸包裝實(shí)施必要的檢疫、消毒、衛(wèi)生除害處理后，簽發(fā)《入境貨物通關(guān)單》（入境廢物、活動(dòng)物等除外）供報(bào)檢人辦理海關(guān)的通關(guān)手續(xù)；
　　4）貨物通關(guān)后，入境貨物的貨主或其代理人需在檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu)規(guī)定的時(shí)間和地點(diǎn)到指定的檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu)聯(lián)系對(duì)貨物實(shí)施檢驗(yàn)檢疫。
　　5）經(jīng)檢驗(yàn)檢疫合格的入境貨物簽發(fā)《入境貨物檢驗(yàn)檢疫證明》放行，經(jīng)檢驗(yàn)檢疫不合格的貨物簽發(fā)檢驗(yàn)檢疫處理通知書，需要索賠的簽發(fā)檢驗(yàn)檢疫證書。
　　出口報(bào)檢流程：接單、審單、預(yù)錄、申報(bào)、驗(yàn)貨、放行、下帳
　　1）接單
　　報(bào)檢操作人員接到客戶或內(nèi)部轉(zhuǎn)來的單據(jù)后，在專門的登記薄上登記，有特殊要求的應(yīng)注明，并詢問出口的大致日期，出口運(yùn)輸方式是否需要出具檢疫部門的證書等。
　　2）審單
　　首先要核對(duì)出口報(bào)檢單據(jù)是否齊全。單據(jù)有：發(fā)票、裝箱單、合同、報(bào)檢委托書(青島企業(yè)必須提供正本報(bào)檢委托書)；有特殊要求的其他單據(jù)：使用信用證結(jié)匯的須提供信用證復(fù)印件、貨物外包裝（紙箱、塑編袋、網(wǎng)袋、桶包裝的涉及食品安全衛(wèi)生標(biāo)示的），必須提供《出境貨物運(yùn)輸包裝性能檢驗(yàn)結(jié)果單》正本；出口換證商品必須提供《出境貨物換證憑單》正本；出口安全質(zhì)量許可、食品衛(wèi)生監(jiān)督等管理范圍之內(nèi)的商品，必須提供生產(chǎn)廠家的兩證管理編號(hào)以及廠檢合格單等；出口熏蒸貨物必須提供場站入貨通知書，并且確認(rèn)貨物存放于場站熏蒸區(qū)。
　　3）預(yù)錄
　　（1）出口單據(jù)審核完畢后，使用九城單證系統(tǒng)對(duì)單據(jù)進(jìn)行預(yù)錄入。預(yù)錄入過程中，可以根據(jù)系統(tǒng)提示制單，并且可以根據(jù)系統(tǒng)對(duì)商品編碼的要求最終確認(rèn)所需單據(jù)是否齊全。（九城單證系統(tǒng)在線更新，所以很多編碼要求及時(shí)更新）
　　（2）在制單過程中出現(xiàn)計(jì)量單位與海關(guān)的計(jì)量單位沖突時(shí)，第一計(jì)量單位按商檢規(guī)定的計(jì)量單位輸入，第二計(jì)量單位按海關(guān)的規(guī)定輸入。
　　（3）在制單預(yù)錄入的過程中如果出現(xiàn)問題應(yīng)及時(shí)與客戶或操作人員聯(lián)系。
　　（4）一般在預(yù)錄入后待系統(tǒng)自動(dòng)生成預(yù)錄入報(bào)檢編號(hào)后，打印報(bào)檢出境貨物報(bào)檢單，交給報(bào)檢員。
　　4）申報(bào)
　　（1）報(bào)檢員在接到全套申報(bào)單據(jù)發(fā)票、裝箱單、合同、報(bào)檢委托書(青島企業(yè)必須提供正本報(bào)檢委托書)、有特殊要求的其他單據(jù)后，在報(bào)驗(yàn)申請(qǐng)單上填寫隨附單據(jù)并注明，報(bào)檢員簽名。
　　（2）到報(bào)檢前臺(tái)申報(bào)，隨時(shí)解答商檢官員對(duì)商品的提問，報(bào)檢員必須對(duì)所申報(bào)商品及客戶情況有所了解。
　　（3）申報(bào)完成，報(bào)檢員根據(jù)申報(bào)貨物的不同，將申報(bào)單據(jù)轉(zhuǎn)往各個(gè)科室，并且根據(jù)各個(gè)科室的不同要求對(duì)單據(jù)進(jìn)行登記。
　　5）驗(yàn)貨
　　（1）申報(bào)完畢的單據(jù)，報(bào)檢員要及時(shí)聯(lián)系客戶驗(yàn)貨，到檢疫局科室預(yù)約驗(yàn)貨時(shí)間并告知客戶。
　　（2）驗(yàn)貨完畢后將單據(jù)轉(zhuǎn)回各科室。
　　6）放行
　　（1）出口驗(yàn)貨后到科室將驗(yàn)貨單據(jù)找出，根據(jù)科室要求不同填寫驗(yàn)貨單據(jù)交科室主管人員簽字，并在電腦中過機(jī)放行。
　　（2）到計(jì)費(fèi)處計(jì)費(fèi)，然后到商檢財(cái)務(wù)繳納檢疫費(fèi)。
　　（3）打印《出口貨物通關(guān)單》，如果需要出具檢疫部門證書的，還需在單據(jù)中注明，以便日后出具檢疫證書。
　　（4）放行后將通關(guān)單交給報(bào)檢操作人員或報(bào)關(guān)人員簽收。
　　7）下帳
　　（1）報(bào)檢員將出口通關(guān)單及商檢發(fā)票交給操作人員，操作人員將其復(fù)印登記留底，并注明公司編號(hào)。
　　（2）將正本通關(guān)單交給報(bào)關(guān)員報(bào)關(guān)使用。