距離發改委對商船三井在內的8家滾裝貨物國際海運企業汽車運輸涉嫌壟斷行為調查已經一年多，墨西哥時間2017年6月9日，墨西哥聯邦經濟競爭委員會（The Federal Economic Competition Commission of Mexico,FECC）在宣布，包括商船三井在內的七家航運公司違反了墨西哥有關滾裝運輸服務的反壟斷法，并予以相應懲罰。
　　商船三井及其他船公司因涉嫌違法發壟斷法，遭到墨西哥聯邦經濟競爭委員會調查。在調查期間，商船三井密切配合墨西哥聯邦經濟委員會的調查。
　　罰款是在2009年至2015年間生效的9個單獨合同，據此，公司將市場分為汽車、農場和工程機械運輸。被該機構罰款的船公司有南美輪船（CSAV）、川崎汽船（K-Line）、川崎汽船美國分公司、日本郵船（NYK）、華輪威爾森物流公司、商船三井（MOL）和商船三井散貨。
　　地方當局確定，航運公司勾結汽車運輸公司，分配給世界各地的五個墨西哥港口和七個國家之間的特定托運人。
　　盡管墨西哥聯邦經濟競爭委員會表示，這些公司承認違反墨西哥反壟斷法，并處以5.81億墨西哥比索（約合34.6億日元）的懲罰。但是根據墨西哥條例，除以1.12億墨西哥元（約合6.68億日元，即3200萬美元）作為名義上的懲罰外，商船三井及旗下子公司在內，免除一切懲罰。因為商船三井在墨西哥聯邦經濟競爭委員會正式調查之前終止了上述違法行為，且前者根據該委員會的豁免制度申請了豁免，并得到后者認可。
　　據不完全統計，早在2013年12月24日，美國聯邦海事委員會（FMC）就宣布，因川崎汽船和日本郵船就汽車和其它車輛的運輸業務與其它主要運營商達成一致行動，而這一行為并未報備美國聯邦海事委員會，并且違反了《美國航運法》和《美國法典》，已與兩家企業達成了總額230萬美元的和解協議。同時，在另外的協議里，日本郵船和川崎汽船分別支付了12.25萬美元和11萬美元的附帶民事賠償。商船三井與FMC達成協議，就它和日產汽車公司（Nissan Motor Car Carrier）被FMC起訴涉嫌壟斷經營，支付了130萬美元的罰金。
　　這樣違背市場自由競爭的密謀行為，除了會被處以罰金以外，相關高管鋃鐺入獄也屢見不鮮。早前2015年3月，日本郵船原汽車運營事業部的總經理Susumu Tanaka，就曾因涉及密謀操縱滾裝船運輸價格被美國司法部門判入獄服刑15個月。
　　此外，2015年7月23日，川崎汽船又一次作為被告在美國和由消費者以及汽車、卡車、設備代理商等組成的原告訴訟團達成和解。而此次與川崎汽船一同坐上被告席的還有日本郵船會社（NYK Line）和智利南美航運公司（CSAV）。
　　2015年12月，國家發改委對日本郵船株式會社、川崎汽船株式會社、株式會社商船三井、威克滾裝船務有限公司、華輪威爾森物流有限公司、智利南美輪船有限公司、日本東車輪船有限公司、智利航運滾裝船務有限公司等8家滾裝貨物國際海運企業達成并實施價格壟斷協議的行為依法作出處罰，分別處以2014年度與中國市場相關的滾裝貨物國際海運服務銷售額之4%~9%不等的罰款，合計罰款4.07億元。